焊接箱体上镗孔，如何保证垂直度和同轴度？

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各位大神：这是一个焊接箱体，两侧有两个5mm厚的钢板，中间是卷弯的5mm钢板焊接连起来的，最上面的两个平面是折弯机器折好的90°面，宽40mm。两侧的板最后要经过镗孔，各连接一个法兰，法兰内置轴承，两端的轴承定位旋转轴。问题是：因为焊接变形，往往因为镗孔后，造成两端法兰不同轴，请教大神何解？急